La Historia comienza cuando un extraño enmascarado (El Renegado Fantasma) trata de robar una medalla escarabajo muy valiosa, en su intento por escapar, pierde la medalla. El protagonista, Ikki, la encuentra por casualidad en la orilla de un río. No obstante, el muchacho no tiene un medabot por falta de dinero, pero consigue comprarse un modelo antiguo tipo KBT recomendado por Henry y muy barato el cual ya tiene un nombre y es Metabee.

Pero en una batalla fortuita, Metabee despierta y fulmina a sus rivales con la ametralladora de su antebrazo, ganando la batalla y sorprendiendo a todos. Este es el inicio de una gran aventura donde Metabee, un medabot malhumorado y solitario con la medalla escarabajo, e Ikki, un adolescente que sabe mucho de las estrategias de batalla aunque inexperto en las mismas, tendrán como objetivo ser los mejores de todo Japón y representar al país en el torneo mundial que se celebra.

También conocida como: "Medarot"

NOTA: En occidente, la emisión fue muy distinta a la emisión japonesa. En Japón de emitieron dos series: "Medarot" (52 episodios) y "Medarot Damashii" (39 episodios). En occidente, se juntaron todos los episodios y de dividieron en 3 temporadas, todas bajo el mismo nombre: "Medabots". La primera temporada fue de 26 episodios y se basó en "Medarot", pero no tomó directamente los primeros 26 de dicha serie, si no que tomó los importantes de la historia y se brincó todos los episodios de relleno. Al ver la fama que obtuvo la 1ra temporada, deciden adaptar la segunta mitad de "Medarot" a una segunda de "Medabots" y continuar con la historia, pero, para tener la misma cantidad de episodios que la anterior, deciden poner también en esta segunda temporada todos los episodios de relleno que se brincaron antes, por lo tanto, los primeros 13 episodios de la 2da temporada (episodios 27 al 39) son relleno y el arco argumental se retoma a partir del episodio 14 (o sea, el 40). Los episodios que se emitieron en occidente como 27 al 39 son los episodios japoneses 06, 13, 24, 29, 33, 08, 14, 15, 16, 19, 22, 28, 30 respectivamente. Para la tercera temporada de "Medabots", adaptaron completamente "Medarot Damashii".