Kyosuke Kousaka, un estudiante de preparatoria normal de 17 años, no se ha llevado bien con su hermana menor, Kirino, en años. Por mas de lo que el puede recordar, Kirino ha ignorado sus idas y venidas y lo ve con una mirada aguda. Pareciera que la relacion entre Kyosuke y su hermana, ahora de 14, continuaria asi por siempre. Un dia, sin embargo Kyosuke encuentra una caja de DVDs de una chica magica de anime titulado Hoshikuzu Witch Meruru, que habia caido en la entrada de su casa. Para la sorpresa de Kyosuke, dentro de la caja habia un videojuego para adultos titulado "Imouto to Koishiyo!" (Amor con hermana menor)