Esta historia nos situa en un futuro distante en un lejano punto de la galaxia. La Alianza Galáctica Humana lleva mucho tiempo luchando por su supervivencia en una guerra contr la raza de grotescos seres conocidos como los Hideous. Durante una intensa batalla, Redo, un joven teniente y su arma humanoide móvil, el Chamber, se ven atrapados en una distorsión espacio temporal. Cuando Redo despierta, este se encuentra en la tierra, conocida ahora como el planeta de la frontera perdida. El mundo ha sido completamente engullido por los océanos y la gente vive en barcos gigantes recuperando reliquias perdidas bajo el agua para poder sobrevivir. Redo llega a uno de los barcos de estas flotas, cuyo nombre es Gargantia. Como no tiene idea de la historia del planeta ni de su cultura se ve obligado a vivir junto a Amy, una chica de 15 años, que trabaja como mensajera a bordo del Gargantia. Redo es un soldado y toda su vida ha vivido en la guerra, así que la paz de este lugar lo sorprende.

También conocida como: "Gargantia on the Verdurous Planet", "Suisei no Gargantia"