Los humanos crearon a los seres artificiales para que fueran ellos los que combatieran en las guerras. Tras años de luchas, las asociaciones religiosas prohíben la existencia de dichos seres, dejando de fabricarlos y encerrando a los que ya existían. Por otro lado, tenemos la academia de aviación Cluster E.A. Una academia a la que sólo puede aspirar la más alta elite. Un día, es trasladado a la escuela un nuevo alumno, Agate. Su extraño comportamiento y su capacidad para producir milagros darán pie a las dudas sobre sus orígenes.