True Tears se centra en la historia de un muchacho llamado Shinichiro Nakagami, que tiene habilidad como dibujante. Este vive con sus padres y con una compañera de clase, Hiromi Yuasa, luego de que los padres de ella fallecieron. Shinichiro la conoce hace años, pero siente que desde que ella vive allí su actitud ha cambiado. En la escuela, conoce a una chica extraña llamada Noe Isurugi, quien le hace una "maldición". Poco después se acercará a ella y entablarán una amistad. Shinichiro también suele estar la mayoría del tiempo con sus dos amigos de infancia, Miyokichi Nobuse y Aiko Endo, en la tienda de Imagawayakis de la familia de Aiko, suele ayudarla también.